
Biologické Centrum AV ČR, v.v.i.
Užitečné nástroje a odkazy
Oblasti Open Science & Research Data Management jsou komplexnější, než se na první pohled mohou zdát. Níže najdeš širokou škálu nástrojů, které mají za úkol Ti pomoct. Ať už jde o tvorbu Data management plánu, ověření publikačních politik časopisu pro Tvůj článek, vyhledání oborového datového repozitáře nebo sdílení Tvých výzkumných dat.
Tvorba Data Management plánů a správa dat
Nástroj Akademie věd ČR pro tvorbu Data Management Plánů (DMP). Uživatel je interaktivně veden procesem tvorby DMP, nástroj hodnotí míru naplnění FAIR principů a poskytuje odkazy na metodiky a literaturu. Navíc umožňuje DMP sdílet s celým výzkumným týmem v reálném čase. Navíc umožňuje výběr šablon Horizon, MŠMT, GAČR, TA ČR…
Nejrozšířenější evropská platforma pro tvorbu DMP. Obsahuje šablony velkých poskytovatelů financí a umožňuje spolupráci a sdílení plánů.
Sada nástrojů pro správu výzkumných dat v biologických vědách.
Open Access – nástroje a vyhledávače
Databáze zásad otevřeného přístupu vydavatelů, časopisů a poskytovatelů grantů. Pomáhá autorům zjistit, jak mohou publikovat v režimu Open Access, jaké verze článků mohou sdílet a kde. Pomůže např. ověřit, zda je možné zveřejnit preprint v repozitáři před submitací článku do časopisu.
Publikační platforma s otevřeným přístupem pro publikování výzkumu financovaného Evropskou komisí ve všech oblastech. Platforma usnadňuje příjemcům grantů z Evropské komise dodržování podmínek otevřeného přístupu a nabízí výzkumníkům publikační prostor, kde mohou rychle sdílet své výsledky a poznatky ZDARMA. Platforma je indexována ve Scopus. Díky ní tak lze nahradit publikování v časopisech.
DOAJ – Directory of Open Access Journals
Globální index kvalitních recenzovaných časopisů v režimu open access. Umožňuje vyhledávání otevřených časopisů podle oboru
i regionu. Zajišťuje, že časopisy v něm zařazené dodržují standardy otevřeného publikování a recenzního řízení, čímž pomáhá filtrovat tzv. predátorské časopisy.
Licence a autorská práva
Oficiální web organizace, která spravuje otevřené licence CC. Nabízí přehled všech licencí i příklady jejich použití.
Creative Commons License Chooser
Interaktivní nástroj pro výběr vhodné licence (CC-BY, CC BY-SA, CC0 atd.) pro publikace, data i multimédia.
Citační databáze
Multidisciplinární citační databáze s přísnou selekcí časopisů. Umožňuje pokročilé citační analýzy, sledování impakt faktoru a metrik Journal Citation Reports, vyhledávání publikací napříč všemi vědními oblastmi nebo ověřování Article Influence Score, analýzy publikační činnosti autorů a mnohé další.
Rozsáhlá bibliografická a citační databáze s širokým pokrytím oborů. Nabízí bibliometrické analýzy přes SciVal, profilování autorů, institucí a sledování trendů ve vědě.
Citační manažery
Český citační manažer podporující normu ČSN ISO 690 i další styly. Umožňuje automatické generování citací, export do MS Word, organizaci záznamů a práci s doplňky do prohlížeče.
Reference manager s robustním systémem pro správu PDF, anotace, organizaci literatury a integraci s MS Word přes Mendeley Cite.
Open‑source citační a výzkumný manažer. Ukládá literaturu, poznámky, automaticky generuje citace, podporuje synchronizaci a spolupráci v týmech.
Vyhledávání repozitářů, ontologií a metadatových standardů
Mezinárodní kurátovaná platforma evidující standardy, databáze, repozitáře a datové politiky. Umožňuje vyhledávat ontologie, slovníky, formáty, reportingové standardy i repozitáře. Slouží jako centrální zdroj pro výběr vhodných datových standardů.
Celosvětový registr repozitářů výzkumných dat s více než 3300 záznamy. Umožňuje filtrovat repozitáře dle oboru, typu dat, licencí, přístupových podmínek a dalších kritérií. Pomáhá výzkumníkům vybrat vhodné úložiště v souladu s FAIR.
OpenDOAR – Directory of Open Access Repositories
Pomáhá najít vhodný repozitář pro publikace nebo data (institucionální i oborové). Úzce navazuje na OpenPolicyFinder.
Repozitáře
Institucionální repozitář AV ČR pro bibliografii, plné texty, preprinty a výzkumná data. Automaticky generuje DOI/Handle.
Otevřený multioborový repozitář pro ukládání dat, software i multimédií. Automaticky generuje DOI.
Cloudové úložiště a repozitář pro vědecká data, který umožňuje výzkumníkům ukládat, sdílet a publikovat výsledky své práce, jako jsou datové sady, obrázky, videa či prezentace. Automaticky generuje DOI.
Nástroje a služby CESNET pro ukládání a sdílení dat
(nejde o repozitáře ve smyslu požadavků grantových agentur)
Služba poskytuje prostor pro ukládání a sdílení objemných vědeckých dat v rámci národní e‑infrastruktury.
- Určeno pro velmi velké datové objemy, včetně dat z výpočtů MetaCentra nebo IT4I, která jsou příliš velká pro běžná úložiště.
- Uložiště mají více než 120 PB fyzické kapacity, vysokou redundanci i geografické rozložení (Brno, Dolní Břežany, Jihlava, Ostrava, Plzeň).
- Certifikace ISO/IEC 27001.
- Podporují S3 a RBD rozhraní (Ceph).
- Přihlášení pro BC stejnými údaji jako do Verso.
Cloudové uložiště umožňuje automaticky synchronizovat data mezi různými počítači a mobilními zařízeními uživatele. Data jsou rovněž přístupná přes webové rozhraní. Data lze dále snadno sdílet s kolegy.
- Cloudové úložiště s prostorem 100 GB na uživatele (je možné navýšit).
- Pro operační systémy Windows, Linux , OS X, iOS, Android.
- Automatická synchronizace dat mezi několika zařízeními (na mobilní zařízení dle potřeby).
- Přístup přes webové rozhraní.
- Nastavitelné sdílení se skupinou osob nebo na základě odkazu.
- Verzování dokumentů v rámci jednoho účtu.
- Uložení dat v rámci e-infrastruktury CESNET na území České republiky.
- Datová úložiště jsou certifikována podle normy pro systém managementu bezpečnosti informací.
Jednoduchý a bezpečný způsob předání souborů mezi uživateli, kdy alespoň jeden z nich musí být ověřen prostřednictvím federace eduID.cz (pro zaměstnance BC přístupové údaje jako do Verso).
- FileSender funguje jako úschovna souborů – uploadem souboru a specifikováním komu má být zaslán odkaz ke stažení. Druhá strana dostane mail s odkazem.
- Soubor je v systému uložen nejvýše měsíc, poté je automaticky smazán.
- Velikost souboru až 1,9 TB.
- Doporučujeme využívat pro zasílání výzkumných dat místo veřejných služeb jako je Uschovna apod.
Knihovny
Knihovna Akademie věd ČR (KNAV)
Hlavní vědecká knihovna AV ČR poskytující:
- Přístup k odborným databázím, e‑časopisům a e‑knihám;
- Digitalizované sbírky (Digitální knihovna AV ČR);
- Služby v oblasti Open Science, ASEP, konzultace a školení;
- Podílí se na provozu repozitáře ASEP a poskytuje podporu pro FAIR data;
- Pro zaměstnance BC registrace online ZDARMA.
Akademická knihovna Jihočeské univerzity (AK JU)
Univerzitní knihovna sloužící studentům JU, zaměstnancům BC AV ČR i veřejnosti:
- Široký fond vědecké literatury.
- Přístup k e‑zdrojům, databázím, e‑knihám.
- Nabízí studovny, kopírování, tisk, rezervace prostor.
- Pro zaměstnance BC registrace ZDARMA.
Ostatní nástroje a odkazy
Mezinárodní persistentní identifikátor výzkumníků. Propojuje publikace, datasetové záznamy a granty s konkrétní osobou a usnadňuje administrativu i viditelnost výzkumníka.
Vyhledávač obrázků, zvuků a multimédií (více než 800 mil. záznamů) pod licencemi Creative Commons nebo veřejnou doménou – užitečné pro otevřené vzdělávání, při tvorbě webu, prezentací apod.
OpenAIRE (Open Access Infrastructure for Research in Europe) je celoevropská síť a elektronická infrastruktura, jejímž cílem je prosazovat a podporovat otevřenou vědu (Open Science). Její součástí je více než 15 užitečných služeb pro výzkumníky vč. např OpenAIRE Explore. Jde o otevřený katalog datových sad a výzkumných informací zahrnující 214 milionů publikací, 95 milionů výzkumných datasetů, 821 tisíc položek výzkumného softwaru ze 159 tisíc datových zdrojů, propojená se 4 miliony grantů a 458 tisíci organizacemi.
Kontaktovat podporu
František Vorel
Open Science Manažer & Data Steward

+420 387 775 002
